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World Community Grid Forums
Category: Community
Forum: Teams
Thread: L'Alliance Francophone |
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Thread Status: Active Total posts in this thread: 220
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Former Member
Cruncher Joined: May 22, 2018 Post Count: 0 Status: Offline |
Voilà la traduction d'un message qui avait été posté sur le topic Genome Comparison http://www.boinc-af.org/index.php?option=com_...amp;id=358&Itemid=233 C'est dingue tu traduits tout ce qui te tombes sur la main !  Bel effort  JPG -- |
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Former Member
Cruncher Joined: May 22, 2018 Post Count: 0 Status: Offline |
Voilà la traduction d'un message qui avait été posté sur le topic Genome Comparison http://www.boinc-af.org/index.php?option=com_...amp;id=358&Itemid=233 C'est dingue tu traduits tout ce qui te tombes sur la main ! Bel effort JPG -- Oui, ça fait longtemps que je l'ais traduit celle là, elle date du 5 Janvier 2007. Comme je l'ais mis dans le premier post, toutes les traductions concernant World Community Grid sont concentrées ici : http://www.boinc-af.org/content/category/9/81/287/ Il y en a 57 en tout sur un peu plus d'un an  |
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pas93
Cruncher Joined: Mar 24, 2007 Post Count: 26 Status: Offline |
Justement, ils disent tous qu'il ont les meilleurs algorythme. Mais au final, les résultats sont toujours assez proche.
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Former Member
Cruncher Joined: May 22, 2018 Post Count: 0 Status: Offline |
Justement, ils disent tous qu'il ont les meilleurs algorythme. Mais au final, les résultats sont toujours assez proche. C'est pas eux qu'ils le disent, c'est juste logique et évident puisque Smith-Waterman est l'algorithme standard de recherche de similarité Et donc il en découle que Smith-Waterman est obligatoirement plus précis que les algorithmes heuristiques comme FASTA. Puisque le principe même de FASTA et BLAST c'est de calculer plus vite que Smith-Waterman. Mais obligatoirement tu y perd en sensibilité http://www.isrec.isb-sib.ch/~jiglesia/etc/lectures/ph_bucher/node15.html Le principe d'un algorithme heuristique et de faire un test rapide bon marché en terme de calcul pour déterminer si une région de l'espace de recherche pourrait donner de bons résultats, auquel cas, un algorithme exact est déclenché. En général, les algorithmes Blast et Fasta éliminent 99% de la base de donnée à chercher par ce test simple et se concentre sur le pourcent restant des séquences. Par définition, toutes les options qui augmentent la vitesse d'exécution d'un algorithme heuristique vont diminuer sa sensibilité. [Edit 1 times, last edit by Former Member at May 19, 2007 9:46:39 AM] |
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[AF>FRANCE]FRED
Cruncher Joined: May 5, 2007 Post Count: 12 Status: Offline |
ALLEZ L'AF ON SE MOTIVE !!!
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pas93
Cruncher Joined: Mar 24, 2007 Post Count: 26 Status: Offline |
Mouai. Mais dans se cas pourquoi esque Simap et Rosetta l'on fait si il savait que ça serait faux ? ^^
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Former Member
Cruncher Joined: May 22, 2018 Post Count: 0 Status: Offline |
Mouai. Mais dans se cas pourquoi est ce que Simap et Rosetta l'on fait si ils savaient que ça serait faux ? ^^ Non ce n'est pas des valeurs fausses, c'est juste qu'avec les algorithmes heuristiques tu trouve un peu moins de similarités. Les résultats sont un peu moins complet. Il faut voir que le projet Simap a été commencé en 2003, les calculs étaient alors faient en interne. Donc pour eux c'était inconcevable de construire une base de données avec l'algorythme Smith-Waterman. Avec leurs moyens interne de l'époque ça leur aurait pris plus de 10 ans. Ils ont donc décidé de construire leur base avec FASTA qui étaient pour eux un bon compromis vitesse/qualité. Le projet Boinc n'est venu que plus tard, le 6 Novembre 2005. Genome Comparison est arrivé juste au bon moment pour lancer un projet sur la base de Smith-Waterman Et en recherche scientifiques c'est toujours intéressant d'avoir 2 résultats avec des moyens différents pour y arriver, donc ça sera intéressant d'avoir 2 bases données libres différentes. Les scientifiques voulant trouver des protéines similaires pourront tester sur les 2 bases. Par contre Rosetta n'a pas vocation à construire de base de données. Ce n'est pas leur but. |
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pas93
Cruncher Joined: Mar 24, 2007 Post Count: 26 Status: Offline |
Ok merci de l'info
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Former Member
Cruncher Joined: May 22, 2018 Post Count: 0 Status: Offline |
Je suis rentré dans le top 3000 des contributeurs à WCG
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Aoameri
Cruncher Joined: May 21, 2007 Post Count: 1 Status: Offline |
Salut je suis un petit contributeur à WCG mais je fais de mon mieux! Vive l'AF!
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